МИНОРНЫЕ НУКЛЕОЗИДЫ
,
пуриновые и пиримидино-выс нуклеозиды
, входящие в молекулы прир.
нуклеиновых к-т в относительно небольших кол-вах. В отличие от наиб. распространенных
нуклеозидов (аденозина, гуанозина, ури-дина, тимидина и цитидина) содержат модифицир.
гетеро-циклич. основания и(или) остатки рибозы или дезоксири-бозы.
М. н. обнаружены практически
во всех нуклеиновых к-тах. Наиб. высокое содержание М. н. наблюдается у эукариотич.
транспортных РНК (тРНК), у к-рых доля М.н. достигает 20-25% от общего кол-ва
нуклеозидов. Значительно меньше (1-2%) М. н. в рибосомных РНК (рРНК). У последних
М. н. сосредоточены в огранич. числе мест. В отличие от РНК содержание М.н.
в ДНК разных организмов сильно варьирует. Так, в ДНК насекомых М.н. достоверно
не обнаружены, в ДНК позвоночных их содержится 1-2%, а у растений эта величина
достигает 3-8%. М.н. находятся в ДНК обычно не в уникальных, а в повторяющихся
последовательностях.
Характер модификаций в
М. н. варьирует очень широко, но в значит. степени преобладает N-, О- и С-метилирование
оснований.
В ДНК растит. и животных
тканей встречается, как правило, только 5-мстил-2-дезоксицитидин (обозначается
m5dC; ф-ла I, X = Н, Y = СН3; dRib-остаток 2-дезокси-рибозы),
а у прокариот (бактерии и синезеленые водоросли)-также его изомер (m4dC;
ф-ла I, X = СН3, Y = H) и N6-метил-2-дезоксиаденозин
(m6dA; ф-ла II); в меньших кол-вах присутствуют N1-метил-
и N2 -диметил-2-дезоксигуанозин (m1dG и m22dG;
ф-ла III, соотв. X = СН3, Y = Н и X = Н, Y = СН3). Единственная
отличная от метилирования модификация в ДНК состоит в замене 5-метильной группы
тимина в ДНК Т-четных фагов (вирусов бактерий) на гидроксиметильную группу,
к-рая м. б. также гликозилирована.
В РНК бактерий метилированию
подвергаются в осн. гетероциклич. основания, тогда как у высших организмов М.н.
в РНК представлены гл. обр. 2-О-метилрибозидами (Nm; ф-ла IV, В-основание).
Наиб. структурное разнообразие М.н. характерно для тРНК, где м. б. модифицированы
все четыре типа нуклеозидных звеньев. При этом М.н. образуются не только в результате
присоединения к ге-тероциклу или к экзоциклич. аминогруппе разл. группировок,
в простейшем случае - группы СН3 (напр., 5-мети-луридин-т5U;
ф-ла V, X = Y = О, Z = СН3, Rib-остаток рибозы), но также в результате
восстановления двойной связи в положении 5,6 пиримидина (5,6-дигидроуридин-hU;
ф-ла VI).
Кроме того, М.н. могут
образовываться в результате замены карбонильного атома кислорода на атом серы
(2-или 4-тиоуридин-S2U и S4U; ф-ла V, соотв. X = S, Y
= О, Z = Н и X = О, Y = S, Z = H) или аминогруппы на гидро-ксил (инозин-ф-ла
VII), а также в результате изменения взаимного расположения урацильного и углеводного
остатков с образованием С-гликозидной связи (5-рибозилурацил, или псевдоуридин,-y;
ф-ла VIII).
Известно немало М.н., модифицированных
по двум позициям (напр., 5-мстил-2-тиоуридин-m5s2U; ф-ла
V, X = S, Y = О, Z = СН3), а также М.н. с заместителями, образующимися
в результате ряда последовательных модификаций, напр. производное уридина (mcm5s2U;
ф-ла V, X = S, Y = О, Z = CH2COOCH3) и аденозина (ms2t6A;
ф-ла IX), в т.ч. циклизации (напр., виозин-W; ф-ла X). Такие гипермодифицированные
М.н. всегда занимают в молекуле тРНК позицию 37, т.е. соседствуют с 3-концевым
нуклеозидом антикодона- участка молекулы тРНК, состоящего из трех нуклсотидов
и узнающего соответствующий ему участок из трех нуклеотидов (кодон) в молекуле
матричной РНК при трансляции (синтезе белка на РНК-матрице).
Образование М.н. в РНК
и ДНК происходит на поли-нуклеотидном уровне (т. е. после того, как полимерная
цепь уже сформирована) путем переноса соответствующих групп спeциализир. ферментами
с доноров в определенные положения нуклеиновой к-ты. Полнее всего изучено метилиро-вание,
к-рое во всех случаях (за одним исключением) осуществляется
с участием S-аденозилметионина - универсального донора метильной группы. Ферменты,
катализирующие образование М. н., высокоспецифичны к определенному нуклеозиду
и к разным позициям его в молекуле.
Описано влияние ДНК с метилир.
основаниями на ряд процессов (экспрессия генов, репликация и др.), однако мол.
механизмы, лежащие в основе этого явления, не выяснены. Несколько больше известно
о роли М.н. в ф-ции тРНК. Возрастание кол-ва М.н. в тРНК по мере усложнения
организмов указывает на то, что они имеют отношение к добавочным, напр. регуляторным,
ф-циям тРНК, поскольку фундам. механизмы переноса аминокислот сходны во всех
организмах. Даже самая простая модификация, напр. ме-тилирование, влияет на
конформацию молекулы, меняя способность к образованию водородных связей и стэкинг-взаимод.
между основаниями. Т. обр., влияние М. н. на ф-ции тРНК осуществляется, вероятно,
через изменение ее конформации, причем разные по структуре и положению М.н.,
безусловно, играют разл. роль. Напр., неизменность локализации гипермодифицированных
М.н. с 3-стороны от антикодона позволяет предположить их участие в считывании
кодона. М. н. в рРНК, по-видимому, участвуют в приобретении молекулой конформации,
необходимой для взаимод. с рибосомными белками.
Лит.: Органическая
химия нуклеиновых кислот, М., 1970; Романов А. Г., Ванюшин Б. Ф., "Биологические
науки", 1980, № 11, с. 5-20; их же, там же, 1981, № 1, с. 5 13; Saenger
W., Principles of nucleic acid structure, N. Y., 1984.
Т. В. Вeнкстерн.
|